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陈苏宁教授NGS在血液病精准诊断中的应用



首届中国血液学发展大会于年1月29日至30日以线上交流的形式召开,会议主题为“新阶段、新理念、新格局——开启血液学高质量发展新征程”。本次会议邀请了血液学及其相关领域专家和同仁,共同探讨中国血液学发展大计。在“精准诊断专题论坛”的直播中,医院陈苏宁教授以“NGS在血液病精准诊断中的应用”为题进行演讲,医脉通将报告的主要内容整理如下。

陈苏宁教授

苏州大学教授、主任医师、博士研究生导师

江苏省血液研究所副所长

中华医学会血液学分会委员

江苏省医学会血液学分会候任主任委员

主持美国白血病淋巴瘤协会、江苏省杰出青年基金、国家自然科学基金等项目10余项

获年吴孟超医学青年基金奖荣获国家科技进步奖二等奖2项,省部级科技进步一等奖3项

作为通讯作者在Blood、Leukemia、Haematologica等刊物发表SCI论文50余篇

NGS在血液肿瘤诊疗的应用

血液肿瘤的诊断和分型依赖于形态学、免疫表型检测、分子遗传学检测等多种检测方法的联合使用。陈苏宁教授表示各类细胞和分子遗传学技术是现代血液病诊断、分型、风险分层、疗效判断的核心技术。随着遗传学技术的进展,特别是基因芯片和第二代测序技术的发展,使得对遗传学异常的分辨率越来越高,已达到单个碱基水平,众多基因异常特别是基因突变的发现,加深了对血液肿瘤发病机制的理解,也对血液肿瘤的诊断和治疗产生巨大影响。

陈苏宁教授随后对目前的NGS平台进行了介绍,他表示NGS平台各有优劣:Ion测序仪对相同数据量测序速度快;Illumina测序仪数据质量更好,通量更大。建库方法中扩增子方法建库简单、建库速度较快、测序仪数据量利用率高、建库及测序成本相对较低、建库模板量要求低;探针捕获方法适用大组套检测、高GC区域覆盖度更好、大片段插入缺失突变检出率高。

NGS技术在血液肿瘤中的应用领域包括:诊断和分型、危险度分层、治疗靶点筛选、微小残留病检测、耐药机制。血液肿瘤中越来越多的分子异常作为诊断、分型、亚型鉴别的重要依据。单纯依靠传统MICM检测技术,难以胜任对血液肿瘤分型有重要意义分子标志的检测任务。NGS技术有着独特的高通量检测优势。超过60%的急性淋巴细胞白血病(ALL)患者可检出核型异常,对指导治疗和判断患者的预后有重要意义,并已成为WHO分型的重要依据。随着芯片和新测序技术的应用,ALL患者中发现越来越多的基因突变或其他异常,并逐渐应用于ALL的临床诊疗。

NGS依赖的分子标志物对患者的危险度分层具有重要的价值,目前临床指南中均纳入了细胞遗传学和分子标志物的危险度分层。MDS预后国际工作组分子委员会数据分析显示:12个基因提示MDS患者生存缩短。年公布的一项BCR-ABL1样ALL的基因组学研究结果显示:Ph样ALL的分子异常可以提供靶向治疗线索。NGS技术检测MRD的标志包括:基因突变、融合基因、Ig和TCR重排,其中Ig和TCR重排适用于大多数急性和慢性淋巴系统肿瘤。

TKIs耐药是慢性髓细胞白血病(CML)治疗的主要障碍,包括原发和继发耐药。研究显示TKIs的耐药机制和ABL1激酶区突变、BCR-ABL1基因的扩增等因素存在关联。直接测序法是核算序列鉴定的金标准,也是目前最广泛使用的检测方法。其优点在于直接分析基因序列,可检测所有可能发生的突变,缺点在于敏感度低、耗费人力、效率较低。目前指南已经推荐使用NGS检测耐药突变。

NGS在非恶性血液病诊疗中的应用

出凝血疾病属于非恶性血液病,包含出血性疾病和血栓性疾病。陈苏宁教授表示与恶性血液病相比,出凝血疾病具有牵涉多个系统及临床各个学科、包含大量罕见病种、诊断和治疗依赖于实验室检测的特征。医院年至年对例出凝血疾病患者基因检测结果统计显示:例患者确诊遗传缺陷,确诊率43.3%,发现新致病基因位点51例/66个位点。

陈苏宁教授最后总结道:NGS对血液病的诊断、分型、危险度分层、治疗靶点筛选、疗效判断和MRD监测有重要意义。NGS将与其他血液病诊断技术有机整合,成为血液病精准治疗的核心技术,需要正确发挥NGS技术在血液病诊断中的价值。

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